Sonic palaa Nintendo DS:lle kaikella klassisella 2D-kaksoisnäyttötoiminnalla, jota fanit rakastivat Sonic Rushissa, sekä uudella avomeriseikkailulla, jossa hän kohtaa häikäilemättömiä merirosvoja. Sonicin myötä pelaajat lähtevät Windmill Villagesta tutkimaan seitsemää toiminnantäyteistä tasoa, joissa on klassinen 2D-pelattavuus, josta Sonic-sarja tunnetaan. Nyt pelaajat pääsevät tutkimaan toimintavaiheita löytääkseen arvokkaita esineitä ja materiaaleja, joiden avulla Tails voi rakentaa uusia aluksia, jotka auttavat Sonicia tutkimaan avomerta. Jopa viiden aluksen laivaston, mukaan lukien sukellusvene, vesipyörä ja ilmatyynyalus, pelaajat käyttävät kosketusnäyttötekniikkaa jännittävillä uusilla tavoilla ohjatakseen aluksiaan, kun ne kilpailevat valtameren poikki, keräävät renkaita, tekevät temppuja ja polttavat merirosvolaivoja rajuissa laivojen välisissä taisteluissa. Jokaisen tason lopussa pelaajat testaavat taitojaan eeppisissä 3D-pomotaisteluissa, jotka kattavat molemmat ruudut, mukaan lukien äärimmäinen välienselvittely pahan merirosvo Kapteeni Viiksen kanssa. Seikkailu alkakoon